Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC82Q8N4S0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms