Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDDC3Q8N4P3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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