Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms