Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FREM1Q5H8C1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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