Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
KLHL12Q53G59 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms