Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SP6Q3SY56 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SP6Q3SY56 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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