Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC96Q2M329 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms