Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDO1Q16878 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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