Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDR2Q16832 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms