Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZIC1Q15915 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZIC1Q15915 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZIC1Q15915 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZIC1Q15915 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZIC1Q15915 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZIC1Q15915 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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