Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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