Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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BRD3Q15059 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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BRD3Q15059 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BRD3Q15059 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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BRD3Q15059 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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BRD3Q15059 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRD3Q15059 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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