Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H3Q13889 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms