Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTCH1Q13635 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTCH1Q13635 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTCH1Q13635 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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