Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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CHAF1AQ13111 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CHAF1AQ13111 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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CHAF1AQ13111 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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CHAF1AQ13111 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHAF1AQ13111 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHAF1AQ13111 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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