Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
STRN3Q13033 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms