Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSTF3Q12996 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms