Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SOX4Q06945 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX4Q06945 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms