Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP7AQ04656 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms