Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.2 ms