Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms