Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAP25P60880 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNAP25P60880 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms