Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP1S2P56377 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP1S2P56377 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP1S2P56377 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms