Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIRAP54198 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms