Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMSP52788 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMSP52788 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SMSP52788 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMSP52788 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMSP52788 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMSP52788 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMSP52788 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMSP52788 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMSP52788 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMSP52788 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMSP52788 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMSP52788 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms