Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ME1P48163 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ME1P48163 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ME1P48163 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ME1P48163 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms