Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIA4P48058 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms