Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNJ1P48048 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms