Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATRXP46100 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ATRXP46100 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRXP46100 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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