Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MLH1P40692 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MLH1P40692 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MLH1P40692 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MLH1P40692 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms