Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGAEP38570 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms