Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCM5P33992 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms