Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms