Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms