Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPREP23469 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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