Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms