Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPCAMP16422 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms