Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CREB1P16220 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms