Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK4P11802 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK4P11802 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms