Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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