Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PDE6DO43924 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PDE6DO43924 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PDE6DO43924 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PDE6DO43924 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PDE6DO43924 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PDE6DO43924 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PDE6DO43924 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PDE6DO43924 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDE6DO43924 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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