Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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PHF1O43189 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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