Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP3O14828 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms