Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUX2O14529 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUX2O14529 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUX2O14529 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUX2O14529 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUX2O14529 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CUX2O14529 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUX2O14529 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUX2O14529 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUX2O14529 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUX2O14529 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUX2O14529 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms