Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms