Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XIRP2A4UGR9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms