Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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FOXD3Q9UJU5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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