Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LAMTOR3Q9UHA4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LAMTOR3Q9UHA4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms