Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEW3

MARCO, Macrophage receptor MARCO, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCOQ9UEW3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARCOQ9UEW3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms