Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms